Ingénieur Bio-Informatique / Data - RHU ATRACTion (H/F)

L’Institut Imagine recrute un Ingénieur Bio-Informatique / Data pour gérer et intégrer les flux de données OMICs et créer un Data Warehouse dédiés au projet ATRACTion.

Institut Imagine

Créé à l’initiative des chercheurs et médecins de l’Hôpital Necker – Enfants malades, l’Institut Imagine, labélisé Institut Hospitalo-Universitaire et Tremplin Carnot, développe des programmes scientifiques fondés sur une continuité entre recherche fondamentale, recherche clinique et soins innovants sur les maladies génétiques rares et les prédispositions génétiques aux maladies plus fréquentes, de l’enfance à l’âge adulte. Imagine a pour ambition d’accélérer la recherche en l’organisant au plus près du malade afin d’apporter les solutions diagnostiques et thérapeutiques tant attendues par les patients et leurs familles.

En 2019, le projet ATRACTion coordonné par l’Institut Imagine a été lauréat de l’appel à projets RHU vague 4 de l’ANR, dans le cadre du Programme d’Investissements d’Avenir. Sous la responsabilité scientifique du Dr Frédéric Rieux-Laucat, cet ambitieux projet réunit 11 partenaires académiques et industriels dont l’objectif est de mieux comprendre et traiter les immunodéficiences primaires et les maladies auto-immunes associées suivant des approches d’analyse multi-omiques en particulier en single-cell.

L’Institut Imagine recrute un Ingénieur Bio-Informatique / Data pour gérer et intégrer les flux de données OMICs et créer un Data Warehouse dédiés au projet ATRACTion.

MISSIONS ET FONCTIONS

Sous la responsabilité du Responsable de la plateforme Data Science l’ingénieur aura en charge :

  • les échanges techniques avec les partenaires et la DSI ;
  • la collecte des données issues de différentes sources et de divers systèmes, et de l’homogénéisation de leur format de stockage ;
  • la conception d’un entrepôt de données (data Warehouse) dédié au projet ;
  • le développpement des pipelines entre différentes source de données.

COMPETENCES

  • maîtrise des bases de données (Oracle, MySQL) et du SQL ;
  • connaissance du secteur biomédical souhaitée ;
  • connaissance du développement de scripts pour les ETL (PHP, Python, Perl) souhaitée ;
  • maitrise des outils ETL d’informatique décisionnelle et des méthodes de data Warehouse ;
  • bonne connaissance du traitement des données massives et des technologies Big Data ;
  • bonne connaissance des technologies d’intégration à l’aide d’interfaces de programmation (API) ;
  • maîtrise de l’anglais technique.

QUALITES

  • Rigueur, organisation, autonomie et polyvalence
  • Sens du travail en équipe et du service

DIPLOME ET EXPERIENCE

  • Diplôme d'ingénieur ou universitaire (bio) informatique-développement/bases de données
  • Expérience significative dans le domaine de qualification (2 ans minimum).

NATURE DU POSTE

  • CDD OD 30 mois ;

  • Prise de fonction au 1er janvier 2021 ;
  • Localisation : Institut Imagine - 24 boulevard du Montparnasse 75015 PARIS ;
  • Salaire selon profil et expérience.

MODALITES DU RECRUTEMENT

Le dossier de candidature, comprenant une lettre de motivation et un curriculum vitae détaillé, est à adresser sous la référence Imagine_179, à Nicolas Garcelon, Responsable de la plateforme de Data Science.