Jean‑Baptiste DUPONT
Génomique
Publié le 12.10.2026
Présentation
La plateforme de génomique a été créée en 2008 pour fournir des services de séquençage et d'expression génique à haut débit à la communauté de recherche de Necker. L'installation effectue toutes les étapes de biologie moléculaire nécessaires pour produire des données brutes à partir des échantillons d'ADN et d'ARN fournis par les utilisateurs. Le plan expérimental ainsi que l'analyse et l'interprétation des résultats sont réalisés de manière interactive avec les chercheurs et la plateforme de bioinformatique (Fondation Imagine/Université Paris Descartes)
Pour les utilisateurs / To users
Vous trouverez ici un fichier contenant tous les appareils et les applications disponibles sur la plateforme en 2025. Ainsi que les prérequis en terme de matériel et concentrations d'acides nucléiques à nous fournir.
Here you will find a file containing all the devices and applications available on the platform in 2025, as well as the input requirements and the nucleic acid concentration specifications to be provided to us.
Here you will find a file containing all the devices and applications available on the platform in 2025, as well as the input requirements and the nucleic acid concentration specifications to be provided to us.
Récapitulatif application génomique input et prix
Dépôt d'échantillons / Samples' deposit
Les dépôts d'échantillons se font le lundi, en envoyant la fiche de soumission des échantillons associée au dépôt.
Samples' deposit are to be done on mondays and associated with the samples submission file which has to be sent by mail.
Fichiers soumission ADN-seq (WGS / exome / ciblé) / DNA-seq (WGS / exome / targeted) submission file :
Samples' deposit are to be done on mondays and associated with the samples submission file which has to be sent by mail.
Fichiers soumission ADN-seq (WGS / exome / ciblé) / DNA-seq (WGS / exome / targeted) submission file :
Équipements
La plateforme de génomique a acquis son premier séquenceur de nouvelle génération en 2010 et a augmenté et adapté ses capacités de séquençage au fil du temps avec notamment l'arrivée des technologies long-reads à partir de 2024.
Technologies de séquençage:
Séquençage short-reads :
- Novaseq6000, Illumina
- iSeq100, Illumina
Séquençage long-reads :
- Revio, Pacbio
- Promethion P2i, Oxford Nanopore Technologies
Contrôles qualité ADN/ARN:
Electrophorèse capillaire :
- Fragment Analyzer (Agilent)
- Femto Pulse (Agilent)
- TapeStation 2200 et 4200 (Agilent)
Dosage fluorométrique :
- Qubit (LifeTechnologies)
Dosage spectrophotométrique :
- Xpose (Unchained Labs)
Fichiers soumission QC RNA ou RNAseq / RNA QC or RNAseq submission file :
Fichiers soumission Amplicon-seq / Amplicon-seq submission file :
Fichiers soumission Plasmide-seq / Plasmids-seq submission file :
