Agnese Loda est titulaire d'un doctorat en épigénétique de l'Université Érasme de Rotterdam (Pays-Bas), où elle a été formée dans le laboratoire du Pr Joost Gribnau. Au cours de ses recherches doctorales, elle s'est concentrée sur l'inactivation du chromosome X et a acquis une véritable expertise en biologie moléculaire et en ingénierie génomique.

Elle a ensuite entrepris des recherches postdoctorales dans le laboratoire de la Pr Edith Heard à l'Institut Curie (Paris) et au Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire (EMBL, Heidelberg). Elle y a poursuivi ses travaux en épigénétique du développement, en s'intéressant tout particulièrement aux mécanismes permettant à certains gènes d'échapper à l'inactivation du chromosome X. Au cours de son post-doctorat, elle a été lauréate de la bourse L’Oréal-UNESCO Pour les Femmes et la Science, ainsi que d'une bourse individuelle Marie Skłodowska-Curie du programme Horizon 2020.

Agnese Loda occupe actuellement un poste de Chaire de Professeur Junior (CPJ) à l'Université Paris Cité et a obtenu un financement “Jeune Chercheuse” de l'Agence Nationale de la Recherche (ANR JCJC) pour mener à bien ses recherches.