Mon programme de recherche vise à comprendre comment la maturation de l'ARN façonne l'expression génique au cours de l'hématopoïèse et comment sa dérégulation contribue aux pathologies hématologiques. Après plusieurs années à l'Institut Pasteur consacrées à l'étude de l'épissage alternatif et de la régulation de l'expression génique, j'ai rejoint l'Institut Imagine en 2020, où j'ai progressivement développé un programme de recherche intégré à l'interface entre biologie de l'ARN, hématologie moléculaire et médecine translationnelle.

Dynamique de la maturation de l'ARN au cours de l'érythropoïèse humaine – Nous étudions la régulation dynamique de l'épissage alternatif, de l'utilisation des isoformes de transcrits et de la polyadénylation alternative au cours de la différenciation érythroïde humaine. En combinant transcriptomique à longues lectures et analyses fonctionnelles, nous cherchons à établir un cadre de référence résolu à l'échelle des isoformes pour l'érythropoïèse normale et à identifier les altérations de la maturation de l'ARN pertinentes dans les pathologies érythrocytaires.

Altérations de la maturation de l'ARN dans la mastocytose systémique et les pathologies myéloïdes associées – Nous étudions comment les mutations affectant les voies de maturation de l'ARN, en particulier SF3B1, coopèrent avec la signalisation oncogénique de KIT dans les mastocytoses systémiques associées à des syndromes myélodysplasiques. Notre objectif est de caractériser les altérations transcriptomiques spécifiques de la maladie et d'identifier des vulnérabilités moléculaires susceptibles d'être exploitées à des fins thérapeutiques.

Réactivation de l'hémoglobine foetale par reprogrammation du transcriptome – Nous cherchons à déterminer si la modulation sélective des isoformes d'ARN de BCL11A permet de modifier son activité régulatrice et de réactiver l'expression de l'hémoglobine foetale. En utilisant des approches ciblant l'ARN, notamment des stratégies fondées sur les oligonucléotides antisens et les technologies CRISPR, nous visons à développer de nouvelles stratégies thérapeutiques sélectives d'isoformes pour les β-hémoglobinopathies.

Isoformes pathologiques d'ARN dans la leucémie aiguë lymphoblastique T – Nous utilisons la transcriptomique à longues lectures pour identifier des isoformes d'ARN récurrentes associées à la maladie dans les LAL-T et en déterminer les conséquences fonctionnelles. Les isoformes sélectionnées sont étudiées à l'aide d'approches de perturbation spécifiques d'isoformes afin d'évaluer leur contribution à la signalisation leucémique, à la fitness cellulaire et aux vulnérabilités thérapeutiques.

L'ensemble de ces projets vise à déterminer comment la diversité des isoformes d'ARN contribue à la différenciation hématopoïétique et aux pathologies hématologiques, et à évaluer dans quelle mesure des transcriptomes pathologiques peuvent être reprogrammés de manière sélective à des fins thérapeutiques.

Équipe de recherche

Doctorants

• Milo Migeon — Reprogrammation des isoformes de BCL11A et réactivation de l'hémoglobine foetale
• Eline Haerens — Coopération SF3B1/KIT et altérations de la maturation de l'ARN dans la mastocytose systémique
• Candice Gautier — Isoformes d'ARN associées à la maladie dans la leucémie aiguë lymphoblastique T
• Aya Ghoul — Dynamique des isoformes d'ARN au cours de l'érythropoïèse humaine

Personnel de recherche

• Naïma Ammiche — Bioinformatique
• Valentina Gligorijevic — Ingénierie de recherche

Ancienne doctorante

• Oriane Mauger

Anciens étudiants, stagiaires et chercheurs invités

• Aneta Skotnicová — Chercheuse invitée
• Héloïse Rethore — Élève ingénieure
• Jane Schadtler-Law — Étudiante de Master 1
• Thomas Damaguez — Étudiant de Master 1
• Claudia Sudol — Étudiante de Master 2
• Alexandre Terré — Doctorant, co-encadrement
• Jules Bobin — Élève ingénieur
• Clara Jukic — Élève ingénieure
• Flore Lainey — Élève ingénieure
• Ana Raingeval — Étudiante de Master 1
• Isabel Junceda — Étudiante de Master 2, Magistère de Génétique
• Judit Carrasco — Étudiante de Master 2, Magistère de Génétique
• Anaïs Granjon — Personnel de recherche / ingénierie

Financements sélectionnés et soutien translationnel

Sanofi iAward — Porteur principal
Université Paris Cité — Porteur principal
PRPhD — Porteur principal
Société Française d'Hématologie — Porteur principal
MaRIH — Porteur principal
ANR — Partenaire dans des projets de recherche collaboratifs
Institut Imagine — INNOG Grant, BioLaunchpad

Rejoindre l'équipe

Nous accueillons les candidatures d'étudiants de Master, de doctorants et de chercheurs postdoctoraux motivés par la biologie de l'ARN, l'hématopoïèse et la génomique translationnelle. Les candidatures spontanées sont les bienvenues.