☺ En savoir plus sur vos droits concernant vos données personnelles : cliquez ici
☺ Pour comprendre les diverses terminologies utilisées : glossaire
Portail de transparence, réutilisation des données de santé & droits des personnes
Nous vous informons ci-dessous des recherches cliniques menées par l’institut Imagine ou auxquelles l’institut contribue en collaboration avec l’AP-HP Hôpital Necker Enfants Malades, l’Inserm, et les autres partenaires.
Information concernant la réutilisation des données de santé
Lors de sa participation à une recherche clinique menée par l’Institut Imagine ou à laquelle l’institut contribue, chaque patient participant a signé un consentement ou a reçu une lettre d’information, indiquant la possibilité que tout ou partie de ses données de santé collectées durant la recherche clinique puissent être réutilisées pour réaliser d’autres recherches scientifiques, dans le but de faire progresser les connaissances médicales et thérapeutiques concernant la maladie concernée, et plus globalement les maladies rares d’origine génétique.
Information concernant le traitement et la sécurité des données
Pour chaque recherche clinique, les données des participants sont rassemblées au sein d’une base de données, après avoir été « pseudonymisées », c'est à dire que les données ont été codées. Elles ne sont pas directement identifiantes, ne contiennent ni nom, ni prénom, ni coordonnées personnelles. Seule l’équipe de recherche conserve la liste de correspondance entre le code et le nom de la personne.
Les collections biologiques
Au cours de la prise en charge médicale des patients présentant une maladie rare à composante génétique, divers examens médicaux sont réalisés, et certaines opérations chirurgicales peuvent être effectuées pour traiter le patient. Ces examens comportent des prélèvements biologiques de diverse nature (sang, salive, biopsie de peau, urines, selles, tissus issus des opérations chirurgicale, …). Des prélèvements peuvent également être réalisés chez les parents d’un patient mineur ou chez tout autre membre de sa famille.
Ces échantillons biologiques sont analysés pour déterminer ou confirmer le diagnostic, pour surveiller l’évolution de la maladie et l’état de santé du patient, ou pour vérifier l’action d’un traitement. Une partie des échantillons peut également être conservée dans le cadre du soin, pour vérifier ultérieurement certains éléments et procéder à de nouvelles analyses approfondies. Ils sont conservés au sein d’une collection biologique, ou banque d’échantillons biologiques, notamment au Centre de Ressources Biologiques de l’hôpital Necker Enfants Malades.
A l’issue des analyses prescrites par le médecin, il se peut qu’une partie des échantillons biologiques ne soit pas utilisée, on parle de « reliquats de soin » ou de « résidus opératoires ». Ces échantillons inutilisés pour le soin, peuvent être conservés avec certaines données de santé, au sein des collections biologiques gérées par l’Institut Imagine, à des fins de recherches scientifiques, d'études ou d'évaluations sur les maladies rares à composante génétique.
Les équipes de recherche de l’Institut Imagine utilisent ces échantillons et les données associées (données socio-démographiques, diagnostic, symptômes, traitements, résultats des analyses …) pour mener des programmes de recherche sur les maladies génétiques. Ces programmes de recherche ont été dûment déclarés aux instances réglementaires concernées, et ont pour objectif d’approfondir les connaissances sur les maladies génétiques, en vue d’améliorer le diagnostic et de trouver de nouveaux traitements, pour mieux traiter les patients.
Les personnes (patients, parents et membres apparentés le cas échéant) doivent donner leur autorisation avant que toute analyse génétique soit effectuée dans le cadre du soin. Une note d’information et de consentement à signer leur est remise, informant également de la conservation des éventuels échantillons inutilisés dans un objectif de recherche scientifique, et précisant notamment les éléments suivants :
type d’échantillons conservés, objectifs des programmes de recherche scientifique, modalités de conservation des échantillons, type de données médicales associées,
moyen d’information des recherches scientifiques réalisées à partir des échantillons biologiques et des données conservées dans les collections biologiques,
cadre réglementaire relatif au traitement des données à caractère personnel, notamment les modalités de codage des échantillons et des données associées, permettant de ne pas pouvoir identifier directement la personne,
les droits des personnes en matière d’accès à ses propres données, de rectification, d’opposition, d’effacement, de limitation et de portabilité, conformément au Règlement Général sur la Protection des Données (RGPD) et à la loi « Informatique et libertés », et les coordonnées des personnes à contacter pour exercer ces droits.
Les programmes de recherche scientifiques associées aux collections biologiques sont décrits ci-dessous :
Recherches menées à partir du liquide céphalo-rachidien (LCS), afin d'identifier des biomarqueurs spécifiques de certaines pathologies neurologiques (pathologies pédiatriques neurologiques : infectieuses (méningites, méningo-encéphalites), inflammatoires (lupus érythémateux disséminé), génétiques rares, épileptiques, ...).
Ces recherches permettront également d'étudier de manière approfondie certains diagnostics et de déterminer les caractéristiques communes de sous-groupes de patients.
A titre d'exemple, l'équipe a rapporté pour la première fois la mesure de la protéine interféron alpha dans le LCS grâce à la technique de pointe Simoa dans le contexte des interféronopathies de type I
(maladies rares génétiques caractérisées par une activation constitutive des interférons)."
Programme de recherche sur l'épilepsie, visant à établir un lien étroit entre les aspects cliniques et fondamentaux pour une approche intégrative.
Objectifs du programme :
- identifier de nouveaux gènes impliqués,
- approfondir la compréhension des mécanismes pathologiques clés de l'épilepsie et les encéphalopathies épileptiques et développementales, et développer des modèles in vitro pour mieux les étudier.
Les axes de recherche incluent notamment l'immunité et la neuroinflammation, le système GABAergique, le neurodéveloppement, le sommeil et la neurotransmission dans son ensemble.
Les travaux menés dans le laboratoire des troubles du neurodeveloppement dirigé par le Dr Vincent Cantagrel, visent à identifier les bases moléculaires et physiopathologiques de maladies génétiques rares touchant le neurodeveloppement.
Ces maladies incluent notamment la déficience intellectuelle, les troubles du spectre autistique, les troubles du langage et les anomalies congénitales du cervelet.
Les prélèvements sont donc utilisés pour extraire l'ADN ou l'ARN et tenter d'identifier les mutations responsables de la maladie en utilisant des approches de séquençage haut-débit (exome total ou ciblé ou génome entier), soit par toute autre technique à venir et permettant de faciliter la recherche.
Les cellules issues de biopsies de la peau peuvent être reprogrammées pour devenir des IPCS. Elles sont utilisées pour comprendre la physiopathologie de la maladie, principalement par des études biochimiques ou moléculaires après différenciation en progéniteures neuronaux."
Recherches fondamentales et translationnelles sur les pathologies du globule rouge, visant à approfondir les connaissances en physiologie et en pathologie de l’érythropoïèse, des globules rouges et du métabolisme du fer.
Le programme a pour but d'étudier les formes évolutives et la physiopathogénie des entéropathies. Une partie des échantillons est collectée et utilisée par l'équipe dans le cadre d'un programme de diagnostic et de suivi de patients atteints d'entéropathies et de complications en particulier de lymphomes.
Une partie des échantillons est collectée et utilisée par l'équipe pour analyser les mécanismes qui conduisent à la rupture de l'homéostasie immunitaire intestinale chez les patients.
Tout type d'analyses génétiques pourra être réalisé, aussi bien par les techniques d'exome que par l'analyse du génome complet ou par tout autre technique à venir et permettant de faciliter la recherche."
Programme de recherche du laboratoire d'immunogénétique des maladies auto-immunes et des maladies inflammatoires héréditaires ou non (en relation avec un événement infectieux) de l'enfant ou de l'adulte.
L'ensemble des échantillons a été obtenu en vue d'études approfondies des diagnostiques des déficits immunitaires héréditaires. Ils sont conservés pour des études génétiques, moléculaires et physiopathologiques des maladies concernées.
Tout type d'analyses génétiques pourra être réalisé, aussi bien par les techniques d'exome que par l'analyse du génome complet ou par toute autre technique à venir et permettant de faciliter la recherche. Les lignées cellulaires issues de ces échantillons sont conservées pour des études fonctionnelles, biochimiques ou cellulaires ultérieures."
Programme de recherche visant à identifier les bases moléculaires et physiopathologiques des maladies génétiques rares.
Les échantillons sont utilisés pour extraire l'ADN ou l'ARN et tenter d'identifier les mutations responsables
de la maladie soit par approche de clonage positionnel, soit par approche de gènes candidats, soit en utilisant des approches de séquençage haut débit (exome total ou ciblé ou génome entier), soit par tout nouvelle technique susceptible de faire avancer la recherche.
Les fibroblastes sont utilisés pour des études biochimiques, une fois les gènes identifiés. Ils permettent de comprendre les mécanismes physiopathologiques des maladies associées avec mutation identifiées.
L’étude du développement humain est limitée par le manque de systèmes modèles reproduisant la séquence précise et le timing des évènements cellulaires et moléculaires qui se produisent au cours du développment huamin.
La technologie des IPS (cellules induites à la pluripotence dérivées à partir de cellules somatiques) offre une occasion unique de suivre tous ces évènements in vitro.
En outre, les lignées de cellules IPS peuvent être dérivées à partir de cellules somatiques de patients atteints de maladies génétiques (maladies héréditaires mendéliennes ou multifactorielles) et fournir ainsi un modèle d’étude in vitro des pathologies.
La plateforme IPS reprogramme des cellules somatiques de patients ou d’apparentés. Ces cellules somatiques sont d’origines diverses : fibroblastes, cellules mononuclées de sang périphérique. D’autres types de cellules somatiques pourront être reprogrammés après étude de la faisabilité de leur reprogrammation. Les lignées d’IPS ainsi établies sont ensuite différenciées dans le(s) type(s) cellulaire(s) pertinent(s) afin d’étudier des étapes du développement, afin de modéliser les mécanismes moléculaires impliqués dans les pathologies et de découvrir de nouvelles cibles thérapeutiques.
Entrepôt des données de santé
L’Hôpital Necker Enfants Malades dispose d’un entrepôt de données (EDS), dédié notamment à la recherche sur les maladies rares, en collaboration avec l’institut Imagine, Institut des Maladies Génétiques. Cet EDS est gouverné par les instances de l’EDS de l’Assistance Publique des Hôpitaux de Paris (AP-HP) et les mêmes règles sont appliquées.
L’EDS de l’Hôpital Necker Enfants Malades a été mis en place en particulier afin de réaliser divers types d’étude (évaluation des pratiques de soin, recherches dites non interventionnelles, études de faisabilité des essais cliniques, amélioration des connaissances sur les maladies rares, génération de nouvelles hypothèses scientifiques), à partir des données recueillies dans le cadre du soin, et des données issues de précédentes recherches peuvent également y être intégrées.
Les recherches nécessitant un avis éthique sont soumises pour validation au Comité Scientifique et Ethique de l’EDS de l’AP-HP. Dans le cadre de partenariats élaborés par l’AP-HP, les résultats non individuels constitués uniquement de données agrégées (regroupant plusieurs patients) peuvent être partagés avec des partenaires externes contribuant à la réalisation de la recherche. Les découvertes issues des projets de recherche (résultats, scores, algorithmes, ...) peuvent faire l’objet de publications scientifiques. Elles peuvent également donner lieu à des brevets : les licences accordées sur ces brevets sont susceptibles d’être valorisées financièrement.
La liste des recherches cliniques réalisées à partir des données de l’entrepôt de données de Necker, sont disponibles sur le site de l’EDS de l’AP-HP en cliquant ici
Les patients ont le droit de s’opposer à l’utilisation de leurs données, à tout moment et sans se justifier. Dans ce cas ils doivent s’adresser au directeur de l’hôpital où ils sont ou ont été pris en charge, ou bien ils peuvent indiquer leur opposition en remplissant le formulaire mis à leur disposition en cliquant ici
Le cas échéant, leur opposition n’affectera en rien la qualité de leur prise en charge médicale ou des soins dispensés, ni la qualité de ses relations avec le médecin hospitalier et l’équipe soignante.
Des personnes chargées des relations avec les patients sont également disponibles pour répondre aux éventuelles questions des patients, qu’ils peuvent joindre en complétant le formulaire mis à leur disposition en cliquant ici